EMRC揭示斑马鱼肠道微生物生态演替调控机制

阐明肠道微生物群落的生态演替机制一直以来都是肠道生态学研究的主流方向。为揭示环境调控和宿主发育对肠道微生物生态演替的影响机制，我们通过对斑马鱼孵化和饲养环境的调控来进行研究，以期验证我们的核心假说：宿主发育在调控鱼类肠道微生物群落演替过程中起决定性作用，不局限于环境效应，主要受宿主遗传、免疫、肠道营养和生态位等因素的影响。我们研究发现斑马鱼不同发育阶段能够很好解释肠道微生物群落的演替，而环境效应对幼鱼至成鱼的肠道微生物群落演替影响不明显。肠道微生物在宿主发育过程的演替主要呈现与宿主发育阶段相吻合，而与孵化环境不同和养殖环境改变均无显著关系，且随宿主发育调控肠道微生物演替的均质选择的贡献随之升高。本研究结合宿主和环境效应对肠道微生物群落构建和生态演替进行了系统研究，不仅增强了我们对微生物生态演替调控机制的认识，而且也为其他水生动物肠道生态学研究提供了新思路。

研究成果2021年1月发表在中科院大类（生物学）一区 Top 期刊 npj Biofilms and Microbiomes（IF=7.067），标题为Host development overwhelms environmental dispersal in governing the ecological succession of zebrafish gut microbiota。环境微生物组学研究中心肖凡书博士为第一作者，颜庆云教授为通讯作者。

该研究得到了国家自然科学基金（31802350；92051120； 31672262；51879171）、高校科研业务费青年教师重点培育项目（19lgzd28）、中山大学百人计划（18821107）以及国家重点实验室开放课题（SKLAM005-2018）等项目的支持。

原文链接：https://www.nature.com/articles/s41522-020-00176-2