研究方向

数据科学研究：主要关注数据产生、数据处理、数据分析、数据模拟，以及计算机、生物信息学、基因组学/宏基因组学等分析工具的开发利用：(1)利用高通量测序、基因芯片、蛋白组学和代谢组学等方法获得微生物组学数据；(2)利用已有的数学、统计学及计算机方法进行微生物组学数据分析；(3)建立有效的数学模型和计算机方法以期对微生物组学数据进行深度分析、解释和模拟。

微生物生态学研究：研究微生物生态学理论，重点分析自然生态系统、特定环境系统中的微生物群落：(1)通过合成微生物生态学理论设计专门实验阐明重要微生物生态学理论及其机理；(2)建立有效的生态学研究方法揭示重要的生态学机制；(3)结合常规微生物学分析方法，通过高通量技术分析不同环境(土壤、水体和空气等)中的微生物组成、多样性、功能、演替和进化等科学问题。

系统微生物学研究：以微生物(纯菌)或简单的微生物群落为基础，揭示微生物基因的功能、相互作用及调控机制：(1)阐明重要功能微生物种群及群落的功能；(2)通过新的基因组编辑技术(如CRISPR Cas9)揭示基因功能及调控机制；(3)通过合成微生物生态学方法，明晰微生物相互作用。

微生物技术开发及应用研究：以富集、分离功能微生物及群落为导向，在揭示微生物功能及调控机制的基础上，为微生物所参与的生产实践过程和环境应用提供指导：(1)分离并揭示重要功能微生物及群落的功能；(2)通过微生物组工程方法揭示基因调控机制和相互网络关系；(3)优化功能微生物及群落以提升环境质量、有效利用资源、保证生态安全、 增强人类健康。